《柳叶刀传染病》杂志的新研究表明，2014年卫生机构发现了大约74000个疟疾病例，与埃博拉肆虐前相比，数量比预期更少。这导致了疟疾死亡人数的增长，有可能超过埃博拉导致的死亡人数(2015年6月14日几内亚有2444名死亡)。

在埃博拉疫区，门诊医疗的系统分析表明，卫生机构在疫情期间保持开放的话，门诊人数急剧下降，在影响严重的地区和特定年龄段下降了近一半(42%)，而疟疾治疗成功的病例下降幅度高达69%。

美国亚特兰大疾病预防控制中心博士、第一作者Mateusz Plucinski说，“问题之一是疟疾的早期症状(发热、头疼、全身酸痛)与埃博拉病毒类似。疟疾是发热和卫生机构访问几内亚的主要原因之一，但我们的数据表明，埃博拉疫情爆发后，发热病人由于担心感染埃博拉病毒或被送往埃博拉治疗中心，从而避免就诊。”

2014年12月Plucinski博士及其同事针对几内亚的公共卫生机构展开了跨区域调查，在受埃博拉感染的大部分地区的60个卫生机构进行了调查。他们还采访了医护人员，并分析了2011年到2014年疟疾指标，明确埃博拉疫情对几内亚——疟疾疫情严重的地区——的就诊数量、疟疾病例及治疗的影响。

研究人员发现，与2013年相比，2014年埃博拉疫情期间，接受调查的卫生机构的就诊数量、患者接受疟疾治疗的数量以及注射药物的数量都有了大幅度降低。然而，即使没有报道埃博拉病例的地区也在疟疾病例以及接受疟疾治疗的患者数量上有显著的下降，

在埃博拉疫区，卫生机构工作者比例由埃博拉流行前的98%下降到流行后的74%，而那些积极治疗疟疾病例从三分之二降低到48%。与此相比，运营社区卫生工作者数量有了增长(78%到95%)，同时期未受埃博拉影响的地区治疗疟疾病例也有了增长(63%到96%)。

全国监测数据证实了卫生机构的调查结果，表明即使在第三波疫情之前，埃博拉疫区的每周疑似病例比预期减少22%，在第三波疫情期间下降更多(42%)。

Plucinski说，“未治疗疟疾病例导致社区的疟疾死亡人数增高，以及更多的发热病例。由于治疗中心的大量疑似埃博拉病例需要分流和隔离，这给不堪重负的卫生系统增加了额外的压力。在埃博拉疫情期间，必须时刻保持控制疟疾的努力，以此不会给疟疾控制进展方面造成损害，也不会阻碍埃博拉疫情响应。”